Форум по автобезопасности -
автосигнализации

У вас просто косорылая установка сигнализации. Обратитесь к грамотному автоэлеткрику, что бы он исправил косяки того знакомого, у которого видимо квалификация очень низкая, и он не смог поставить на такую простую машину как Тойота.
Объяснять вам как должно быть бесполезно, вы все ровно ничего сами не сделаете, для вас это будет сложно, это нужно шаить в электронике.
Или распечайте что написал Старик, и дайте почитать вашему знакомому. Может по этим инструкциям он вкурит что нужно сделлать.

Да индикация РКПП должна гореть всегда, это означает что у вас включен режим работы сигнализации с ручной коробкой.

Про тормоз, так и должно быть.

У вас ручная коробка?

Если да, как понял, то педаль тормоза не нужно подключать, а подключать только ручник. Оранжево-фиолет на массу, а сине-красн к ручнику, и развязать диодом, обязательно!