Форум по автобезопасности -
автосигнализации

Для того, что-бы отдельное открывание багажника работало, нужно было разрезать один провод и в разрыв подключить два провода от пандоры. Может у Вас это сделали, только разрезали не тот провод, вот теперь замок пытается закрыться и щелкает. А может это просто через 5 сек проходит импульс на закрытие?
А для того, чтобы в при открывании багажника она не орала нужно отдельно подключить концевик багажника (возможно, через диодную развязку, если по схеме авто все концевики установлены параллельно). Попробуйте открыть багажник (штатным образом) при включенном зажигании, потом зажигание выключите - на брелке багажник открыт? Если нет, то он подключен вместе со всеми концевиками дверей.