Форум по автобезопасности -
автосигнализации

сигнализация подключена к ЦЗ по проводам личины. Это не есть плохо как таковое,но личина игнорируется ЦЗ при некоторых условиях (вставленный в замок зажигания ключ, включенное ключем зажигание). У вас это и происходит.
При ПЗ ЦЗ нормально работает с сигналкой потому, что сигнализация поддерживает не все цепи замка зажигания ввиду не недобности. Видимо ЦЗ подключен к одной из этих "не нужных" линий. А когда включаете зажигане ключем...
Решить проблему конечно можно,было бы желание.