Форум по автобезопасности -
автосигнализации

здесь вы описали,как вам подключили контроль ручника, такое подключение принято называть "аналоговым" в противовес "цифровому" способу получения информации из CAN-шины автомобиля.
Пандора 3500 может работать как по "аналогу",так и по CAN. Сигнал из КАН-шины может быть приоритетным по отношению к аналоговому.
В результате у вас может быть именно такой конфликт статусов. Не смотря на то, что сигнализация получает статус ручника по отдельному проводу, она еще может руководствоваться статусом этого же ручника в КАН-шине (даже если КАН вообще не подключен!), а после включения зажигания некоторая информация в КАН шине может появляться с заметным опозданием. В результате, сигналка считает, что ручник опущен и не выдает сигнал на стартер.
Точно такая-же ситуация может быть и с контролем педали тормоза.
Поэтому, контроль всех статусов по КАНу, которые сигнализация получает не из КАН-шины, должен быть запрещен в 4-й таблице программирования.